所谓“如来藏唯识体系”，就是以唯识法相阐述“如来藏”思想的唯识学体系。 《楞伽经》阐述如来藏思想有一个比较完整的体系，今略述如下：
1、如来藏唯识思想的主旨
唯识观就是佛教“三界唯心，万法唯识”的宇宙观，就是《楞伽经》中， “一切佛语心”的思想主旨(一切诸法佛说皆唯心所造)。《楞伽经》认为万事、万物、万法都是这个“如来藏”的幻化变现。
《楞伽经》的唯识观所体现的“如来藏”，又称“阿赖耶识”、 “第八识”、“藏识”、“识藏”，它包括染净二法，表现为“真识”与“转识”。
“真识”即“净空如来藏”，或“藏识真相”、“自真相识”、“如如境”、“净八识”、 “真如”等，它是自相清净的，不生不灭的。
“转识”或“转相”、
“业相”是由如来藏派生出的假相，是污染的、生灭的。
二者的关系则是：藏识(真识)本身不生不灭，但含摄“转识”与“业相”的生灭假相， “藏识”是体， “转识”等则是相、用，犹如海水与波浪的关系，波浪能生能灭，有生灭相，但海水性不变，不生不灭。“藏识”与“转识”二者之间非异非不异，犹如泥团与微尘的关系。如经中云： “若泥团微尘异者，非其所成，而实彼成，是故不异；若不异者，则泥团微尘应无分别。……转识、藏识实相若异，藏识非因，若不异者，转识灭，藏识亦应灭，而自真实相实不灭。……非自真相识灭，但业相灭，若自真相灭者，藏识则灭。……藏识灭者，不异外道断见论议。”
由此可见， “藏识”(真识)是不灭体性，是“转识”、 “业相”变化的根因。(在《楞伽经》里将所有的识分为三种：真识、现识、分别事识。这里的藏识是指真识而言，转识是现识和分别事识，亦即前七识)。
2、如来藏唯识思想的教相
《楞伽经》以“五法、三自性、八识、二无我”为教相。
五法，即名、相、妄想、正智、如如。 “名”指概念； “相”指事物现象；“妄想”指以名、相为对象的思维分别；“正智”为洞察妄想本质的智慧； “如如”为彻悟后所见的自性。
三自性，即妄想自性、缘起自性、成性自性。妄想自性从相生；依因托缘生起诸法的功能叫缘起自性；离名相、事相、妄想， 圣智所得及自觉圣智所趋向的境界，是成性自性。
八识，即眼、耳、鼻、舌、身、意、末那、阿赖耶识。
二无我，即人无我、法无我。
3、五法、三自性、八识、二无我的关系
《楞伽经》中以“五法”统领三自性、八识、二无我，含摄世间出世间法。
(1)五法统摄三自性。如经中云：“彼名及相，是妄想自性。……若依彼妄想，生心心法，名俱时生，如日光俱，种种分别，分别执，是名缘起自性。……正智如如者，不可坏故，名成自性。”
(2)五法统摄八识。如经中云： “自性现妄想，八种分别：谓识藏(妄想染相即识藏，净相即如如)；意(末那，为我执，带质境，非量)；意识(即第六意识、知见、思维分别、比量)及五识身者。”
(3)五法统摄二无我。如经中云：
“不实妄想故，(生)我、我所，二摄受灭，二无我生。……此五法者，声闻、缘觉、菩萨、如来自觉圣智，诸地相续次第，一切佛法，悉入其中。”
4、藏识无有之论
《楞伽经》又说： “佛告大慧，我说如来藏，不同外道所说之我，大慧，有时说为空、无相、无愿、如实际、法性、法身、涅槃自性、不生不灭、本来寂静、自性涅槃，如是等句……为断愚夫畏无我句，故说离妄想，无所有境界，如来藏门。大慧！未来现在菩萨摩诃萨，不应作我见计著……若不是则同外道。”
这里佛陀特别强调说明，若将如来藏执为实有，则落入外道的“有见”，故为破除此见，佛陀则说如来藏之体为“空、无相”之说。如果学者能彻底理解这段话的含义，那么后世所谓“毕竟空”和“胜义有”的诤论何愁不为之消宁呢?
5、如来藏唯识纲领
①如如：即净空如来藏，由正智以平等慧转染成净，证得成自性。
②如来藏：含五法、三自性、八识、二无我，具染净二法。
⑧妄想：由净入染造我法二执，妄想自性。
④正智：反省觉悟，由染入净。
⑤名相：由妄想无明而生。
如来藏含摄染净二法，由如来藏的如如境，若被妄想无明染污则变成世间名相，若由世间名相起正智净化，则转为如如净相。（信息来源：摘自《彩云法雨》）
